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Directeur scientifique : Julie Dechanet-Merville

Cytométrie en flux avec trieur

Cytométrie en flux

  • Analyser et phénotyper vos échantillons biologiques
  • Trier vos suspensions cellulaires et particulaires
  • Avoir des conseils pour mettre en place vos panels d’anticorps et vos marquages

Cytométrie Bordeaux

Les services de la plateforme Facsility

FACSility propose une gamme d’instruments pour l’analyse de 16 fluorescences

Mise à disposition des équipements après formation

Étude de faisabilité

users

Collaboration scientifique

Qu’est-ce que la cytométrie ?

Elle permet de mesurer sur une suspension de particules, cellules, bactéries, parasites ou billes, les caractéristiques individuelles de chaque particule telles que la taille, la forme et la complexité, ainsi que n’importe quel composant ou fonction pouvant être détecté par un composé fluorescent.

Sur le site de la société Thermo Fisher Scientific, vous trouverez deux excellentes présentations en anglais : introduction à la cytométrie et analyse des résultats.

Les spectres d’excitation et d’émission des principaux fluorochromes sont disponibles aux liens suivants : spectre fluorescence BD ou spectre fluorescence molecular probes.

Autres informations sur la cytométrie à partir du portail de l’International Society of Analytical Cytology.

Formations

Formations pratiques

La plateforme propose deux formations pratiques de 2,5 jours en analyse multicouleur et tri cellulaire.

Ces formations sont qualifiantes et labellisées CNRS Entreprise.

Formation pratique à l’analyse multicouleur

Cytométrie en flux. Formation pratique dédiée à l’analyse multicouleur.

Formation pratique au tri cellulaire

Formation pratique dédiée au tri cellulaire

Équipements

Analyseurs et trieurs

Analyseurs

  • Un Symphony A3 28 couleurs
  • Deux Canto II 8 couleurs avec passeur de plaques
  • Un Fortessa 16 couleurs avec passeur de plaque
  • Un Aurora Spectral, 67 paramètres, 5 lasers (UV, V, B, YG, R)

Trieurs

  • Un Melody 9 couleurs
  • Un Aurora Spectral 40 paramètres, 4 lasers (V, B, YG, R), 6 voies

Détails des équipements

BD FACSymphony™ A3

Le BD FACSymphony A3 offre 30 paramètres sur un maximum de cinq lasers, permettant l’utilisation de nouveaux colorants avec une luminosité et des caractéristiques de débordement améliorées. La possibilité de développer des panels pour un phénotypage plus large, une interrogation plus intense des sous-ensembles cellulaires et des panels améliorés avec une résolution plus élevée permet aux chercheurs d’obtenir des connaissances scientifiques plus approfondies.

De plus amples informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSymphony A3.

Analyseur BD FACSCanto II

L’analyseur BD FACSCanto II est équipé de trois lasers à 488 nm, 633 nm et 407 nm. Il permet l’analyse simultanée de 8 fluorescences. Il est équipé d’un passeur d’échantillon haut débit permettant l’automatisation du passage des échantillons en plaque.

Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSCanto II.

Analyseur BD LSRFortessa

L’analyseur BD LSRFortessa est équipé de quatre lasers à 405 nm, 488 nm, 561 nm et 640 nm. Le laser 560 nm permet une excitation optimale des fluorochromes rouge (phycoérythrine, DsRed, Tomato, Cherry…). Cet instrument permet l’analyse simultanée de 16 fluorescences et il est équipé d’un passeur de plaque à haut débit.

Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD LSRFortessa.

Analyseur Cytek Aurora

L’analyseur spectral Aurora est équipé de 5 lasers : UV à 355 nm, Violet à 405 nm, Bleu à 488 nm, Yellow / Green à 561 nm et rouge à 640 nm. Il possède 64 détecteurs de fluorescence et 3 de morphologie. La mesure des différences de signature spectrale sur tous les lasers et détecteurs permet la combinaison de fluorochromes incompatibles en cytométrie conventionnelle.

L’OMIP-069 a été publié en octobre 2020 avec l’analyse de 40 marqueurs d’un sang humain.

Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page Cytek Aurora.

Trieur Cytek Aurora CS

Le trieur spectral Aurora CS est équipé de 4 lasers : Violet à 405 nm, Bleu à 488 nm, Yellow / Green à 561 nm et rouge à 640 nm. Il possède 40 détecteurs de fluorescence et 3 de morphologie. Comme l’analyseur Aurora, le CS offre les avantages de la technologie de l’analyse spectrale. Sa conception optique et son algorithme de déconvolution offrent une flexibilité accrue, permettant l’utilisation d’un large éventail de nouvelles combinaisons de fluorochromes. Avec un tri jusqu’à 6 voies, des choix de buse et des modes de tri personnalisables, une automatisation des réglages et une surveillance du flux de tri, le CS offre la flexibilité nécessaire pour répondre à toutes les applications.

Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page Cytek Aurora CS.

Trieur BD FACSMelody

Le BD FACSMelody™ est un trieur à buse unique de 100 µm compatible avec tous les types cellulaires, permettant d’isoler jusqu’à 4 populations simultanément dans des tubes ou dans des plaques. La configuration optique 3 lasers et 9 paramètres de fluorescence (3V, 4B, 2R) permet d’identifier facilement la plupart de vos populations cellulaires à trier. La mise en route et le réglage automatique du tri, couplé au logiciel BD FACSChorus, offrent la possibilité d’effectuer vos tris en totale autonomie.

Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSMelody.

Logiciels disponibles

Logiciel de mise en page des résultats

Ce logiciel est installé sur les CantoII, le Fortessa et l’Aria pour l’acquisition des données et leur mise en page.

Logiciel de pilotage du trieur Melody

Ce logiciel est installé sur l’Aurora Analyseur et l’Aurora Trieur pour l’acquisition des données et leur mise en page. Il est également disponible en accès libre sur les postes d’analyses.

Contact

Nous contacter

Email : tbmcore-cytometrie@u-bordeaux.fr
Téléphone : 05.57.57.57.05

Université de Bordeaux
Plateforme FACSility
Laboratoire UAR 3427 / US 005
Bâtiment BBS, 5e étage, S.5085
2 rue Dr Hoffmann Martinot
33000 BORDEAUX

Stockage des données

L’emploi de clé USB ou disque externe est strictement interdit. Utilisez le partage serveur quand vous êtes en cytométrie ou le VPN « Mobilité » quand vous êtes à l’extérieur du service pour accéder à votre espace de sauvegarde sur le serveur du laboratoire.

Règlement intérieur et dépôt de projet

Tout utilisateur du Service Commun de Cytométrie devra avoir lu le règlement intérieur et rempli le formulaire en ligne au dernier paragraphe du document pour accéder au service.

Toute demande de projet doit être soumise par le responsable au comité de pilotage à l’aide du formulaire en ligne.

Planning et réservation

Les cytomètres sont en accès libre selon leur disponibilité pour les utilisateurs formés et autonomes. Une assistance technique est disponible sur rendez-vous pour les autres utilisateurs.

Les tris sur l’Aria et l’AuroraCS sont effectués uniquement par le personnel de la plateforme qui doit être prévenu au plus tard le vendredi de la semaine précédente. Les cellules mycoplasmées ou les échantillons présentant un danger biologique supérieur au niveau 2 (P2) sont refusés.

Dans tous les cas, les appareils doivent être réservés au moins 24 h à l’avance au lien suivant :

JULIE

DÉCHANET-MERVILLE

ATIKA

ZOUINE

VINCENT

PITARD

JEAN-MICHEL

GRIFFON